SMP Negeri 2 Nunukan memiliki lahan seluas 1.584 m2 dengan seluas bungunan 683m² terletak di Jalan Bhayangkara No. IX Kabupaten Nunukan dengan Nomor Induk Sekolah (NIS) 20.015.0, Nomor Statistik Sekolah (N.S.S) 20.1.16.08.04.015.P. NPSN: 30400540 dan Akreditasi: “A” berdasarkan Surat Keputusan nomor: 309/BAP-SM/HK/X/2015 oleh Ketua BAP S/M Provinsi Kalimantan Timur 31 Oktober 2015. Dari segi wilayah, sekolah ini berada ditengah kota, di KelurahanNunukan Barat, Kecamatan Nunukan, Kabupaten Nunukan Kode Pos 77482 Telp/Fax (0556) 21030-23928 email: smp_nnk@yahoo.co.id. Lembaga pendidikan ini berdiri pada tanggal 15 Juli 2002 sampai dengan 26 Juni 2003. Pada masa itu lebih dikenal dengan nama SMP Negeri 10 Nunukan. Kemudian pada tahun pelajaran 2004, tepatnya tanggal 25 Juni 2004 sampai dengan sekarang bernama SMP Negeri 2 Nunukan.
Sebagai kabupaten yang baru dimekarkan yaitu tepatnya tahun 1999, SMP Negeri 2 Nunukan semula bernama SMP Negeri 10 Nunukan, memiliki gedung sekolah eks SMP Negeri 1 Nunukan. Tahun pertama dibuka memiliki 2 (dua) ruang belajar jumlah siswa sebanyak 80 siswa. Jika dibandingkan saat ini jumlah siswa 730 orang anak yang terdiri dari laki-laki sebanyak 375 anak dan perempuan sebanyak 355 anak. Saat itu tenaga pendidik yang berstatus Pegawai Negeri Sipil hanya 1 ( satu ) orang, yaitu merangkap Kepala Sekolah bernama Drs. Rumadi. Sementara tenaga pendidik lainnya yaitu berjumlah 6 orang adalah guru kontrak daerah. Namun saat ini perkembangan yang semakin pesat di SMP Negeri 2 Nunukan membuat jumlah tenaga pendidik dan tenaga kependidikanpun semakin bertambah yaitu jumlah tenaga pendidik yang berstatus PNS sebanyak 29 orang, PPPK sebanyak 10 orang dan tenaga honor guru sebanyak 11 orang begitu juga dengan tenaga kependidikan berjumlah 9 orang termasuk satpam dan kebersihan dan penjaga sekolah.
SMP Negeri 2 Nunukan berada ditengah kota sehingga akses lalu lintas cukup padat saat-saat jam kerja. Karena letak SMP Negeri 2 Nunukan yang berada di dalam kota, maka setiap tahun pelajaran minat masyarakat menyekolahkan anaknya sangat tinggi, namun ketersediaan ruangan kelas belajar dan daya tampung yang terbatas. Sementara tingkat kelulusan setiap tahun menapai 100%.
Pada Tanggal 3 Maret 2008 SMP Negeri 2 Nunukan mengalami musibah kebakaran, mengakibatkan sarana dan prasarana belajar mengajar sebagian besar terbakar yang meliputi 3 ruang belajar mengajar, kantor kepala sekolah, ruang tata usaha, ruang dewan guru, perangkat elektronik, dan multimedia serta dokumen-dokumen penting lainnya yang diperkirakan menelan kerugian sebesar ± Rp 750.000.000,- (tujuh ratus lima puluh juta rupiah). Akibat dari kebakaran tersebut, selama kurang lebih 2 tahun proses belajar mengajar dipindahkan di Sekolah Dasar Negeri 002 Nunukan jalan Fatahillah RT. 10 Nunukan Tengah kecamatan Nunukan kabupaten Nunukan. Pada tahun 2010 pembangunan SMP Negeri 2 Nunukan eks kebakaran rampung dikerjakan, dan proses belajar mengajar kembali di fokuskan di SMP Negeri 2 Nunukan di jalan Bhayangkara RT.IX kelurahan Nunukan Barat kecamatan Nunukan kabupaten Nunukan.
Sejak berdirinya SMP Negeri 2 Nunukan yaitu tahun 2002 sampai dengan sekarang Tahun 2024 Kepala Sekolah yang pernah memimpin adalah :
Kepala Sekolah Pertama : Bpk. Drs. Rumadi ( 2002 – 2006 )
Kepala Sekolah Kedua : Bpk. Drs. Andi Ansar Dapi ( 2006 – 2011)
Kepala Sekolah Ketiga : Bpk. Gumolung Bonte, S.Ip ( 2011 – 2021 )
Kepala Sekolah Keempat : Bpk. Arbain, S.Pd ( 2021 – 2022 ) Sebagai Plt.
Kepala Sekolah Kelima : Bpk. Drs. H. Ahmad ( 2022 – 2023 )
Kepala Sekolah Keenam : Bpk. Djadmoko Budi Santoso ( 2023 – 2024 ) Sebagai Plt.
Kepala Sekolah KeTujuh : Bpk. Arbain, S.Pd ( 2024 – Sekarang )
Telah disebutkan dimuka bahwa pada waktu berdiri hanya memiliki 2 kelas. Oleh karena kemajuan pembangunan, saat ini SMP Negeri 2 Nunukan telah memiliki 26 rombel yang meliputi kelas VII sebanyak 9 (sembilan) rombong belajar, kelas VIII sebayak 8 (sembilan) rombong belajar, kelas IX sebanyak 9 (sembilan) rombong belajar dan ruang-ruang pendukung lainnya dengan jumlah siswa sebanyak 826 orang.
Dan saat ini SMP Negeri 2 Nunukan memiliki dua lokasi gedung yaitu :
1. SMP Negeri 2 Nunukan yang beralamat di Jalan Bhayangkara RT. 10 Kelurahan Nunukan Barat dan;
2. SMP Negeri 2 Nunukan yang beralamat di Jalan Sei. Fatimah Gang Damai Desa Binusan, Nunukan Barat.
Semula SMP Negeri 2 Nunukan memiliki tipe sekolah, tipe “C” (SK. Ketua BAN-SM Nomor : NSS/NIS/NSM . 20.1.16.08.04.015/20.015.0, tanggal 24 November 2008). Namun seiring waktu dan pesat perkembangan pada 31 Oktober 2015 SMP Negeri 2 Nunukan berstatus akreditasi “A” sesuai dengan surat keputusan nomor: 309/BAP-SM/HK/X/2015 oleh DRS. H. Suyatman, S.Pd., MM., M.Si sebagai Ketua BAP S/M Provinsi Kalimantan Timur Selain fisik, prestasi akademik maupun non – akademik yang diraihpun selalu meningkat, baik ditingkat Kota, Provinsi, maupun Nasional.
Visi Misi Sekolah
“Terwujudnya Insan Yang beriman dan Bertaqwa, Berprestasi, Berwawasan Luas, Cinta Tanah Air, Serta Peduli Lingkungan“
- Menciptakan profil pelajar yang berakhlak mulia dan rajin beribadah
- Meningkatkan prestasi akademik dan non akademik
- Menyelenggarakan pendidikan dalam lingkungan yang aman dan nyaman
- Melestarikan fungsi lingkungan, mencegah pencemaran, dan kerusakan lingkungan
- Menciptakan pembelajaran yang menarik, menyenangkan dan berkarakter yang mampu memfasilitasi pelajar sesuai bakat dan minatnya
- Menjamin hak belajar setiap anak tanpa terkecuali termasuk anak yang berkebutuhan khusus (inklusi) dalam proses pembelajaran yang menjunjung tinggi nilai gotong-royong
- Menciptakan lingkungan sekolah sebagai tempat perkembangan intelektual, sosial, emosional, keterampilan, dan pengembangan budaya lokal dalam kebhinekaan global
- Menciptakan profil pelajar yang berakhlak mulia, mandiri, bernalar kritis dan kreatif sehingga mampu mengkreasikan ide dan keterampilan yang inovatif
- Menciptakan lingkungan belajar yang harmonis dan menanamkan sikap saling menghormati dan menghargai antar warga sekolah